Епідеміологічна характеристика SAR-CоV-2 Омікрон

Автор(и)

  • В.Д. Москалюк д-р мед. наук, професор, завідувач кафедри інфекційних хвороб та епідеміології Буковинського державного медичного університету, м.Чернівці, Ukraine
  • Б.В. Сирота канд. мед. наук, асистент кафедри інфекційних хвороб та епідеміології Буковинського державного медичного університету, м.Чернівці, Ukraine
  • І.В. Баланюк канд. мед. наук, доцентка кафедри інфекційних хвороб та епідеміології Буковинського державного медичного університету, м.Чернівці, Ukraine
  • Н.В. Чернецька д-р філософії, кафедра внутрішньої медицини Буковинського державного медичного університету, м.Чернівці, Ukraine
  • С.Р. Меленко канд. мед. наук, доцентка кафедри інфекційних хвороб та епідеміології Буковинського державного медичного університету, м.Чернівці, Ukraine
  • Т.Р. Колотило канд. мед. наук, асистент кафедри інфекційних хвороб та епідеміології Буковинського державного медичного університету, м.Чернівці, Ukraine

DOI:

https://doi.org/10.24061/2413-0737.XXVІ.2.102.2022.4

Ключові слова:

COVID-19; SAR-CoV-2; Омікрон

Анотація

Штам Омікрон вперше зареєстровано ВООЗ у Південній Африці 24 листопада 2021 р. Станом на початок 2022 р. випадки захворювання на Омікрон зареєстровано у понад 60 країнах та регіонах світу. Наразі Омікрон є домінуючим у світі штамом SAR-CoV-2 зі схильністю до швидкого розповсюдження. Хоча хвороба, викликана Омікроном, має переважно безсимптомний чи легкий перебіг, стрімке зростання показника захворюваності може викликати серйозне навантаження на глобальну систему охорони здоров’я. Окрім вищезазначеного, джерела мутацій, характер передачі збудника, його стійкість до вакцин є недостатньо вивченими, чим зумовлена перепона у боротьбі зі збудником у різних регіонах світу. У даній статті проаналізовано результати досліджень щодо характеристики збудника, його мінливості, особливостей передачі та можливих механізмів її реалізації, епідемічного статусу, можливостей профілактики та інших протиепідемічних заходів, з метою розробки заходів щодо боротьби з цим штамом SAR-CoV-2.

Посилання

WHO Coronavirus (COVID-19)Dashboard [2021-12-13]. Available from: https://covid19.who.int/.

WHO Tracking SARS-CoV-2 variants [2021-12-06]. Available from: https://www.who.int/en/activities/trackingSARS-CoV-2-variants/.

WHO Classification of Omicron (B.1.1.529:SARSCoV-2 variant of concern [2021-11-26]. Available from: https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-ofomicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern.

Munitsypal'na komisiia okhorony zdorov'ia Tian'tszinia [Municipal Commission for the Protection of Health of Tianjin].

(天津市卫生健康委员会) [2021-12-14] [Internet]. Available from: http://wsjk.tj.gov.cn/ZTZL1/ZTZL750/YQFKZL9424/FKDT12

/202112/t20211214_5749144.html. (in Ukrainian).

Departament okhorony zdorovia uriadu spetsialnoho administratyvnoho raionu Honkonhu [Department of Health of the Government of the Hong Kong Special Administrative Region] (香港特别行政区政府卫生署) [2021-11-25] [Internet]. Available from: https://sc.isd.gov.hk/TuniS/www.info.gov.hk/gia/general/202111/25/P2021112500378.htm. (in Ukrainian).

Gu H, Krishnan P, Ng DYM, Chang LDJ, Liu GYZ, Cheng SSM, et al. Probable transmission of SARS-CoV-2 Omicron variant in Quarantine Hotel, Hong Kong, China, November 2021. Emerg Infect Dis. 2022;28(2):460-62. DOI: 10.3201/eid2802.212422.

Holovne upravlinnia Natsional'noi komisii okhorony zdorov'ia, Upravlinnia derzhavnoho upravlinnia tradytsiinoi kytais'koi medytsyny. Diahnostyka ta plan likuvannia koronavirusnoi pnevmonii [Main Directorate of the National Health Commission, Department of Public Administration of Traditional Chinese Medicine. Diagnosis and treatment plan for coronavirus pneumonia] (国家卫生健康委员会办公厅,国家中医药管理局办公室 .新型冠状病毒肺炎诊疗方案) [2020-08-18] [Internet]. Available from: http://www.nhc.gov.cn/ yzygj/s7653p/202008/0a7bdf12bd4b46e5bd28ca7f9a7f5e5a.shtml. (in Ukrainian).

Chan JF, Kok KH, Zhu Z, Chu H, To KK, Yuan S, et al. Genomic characterization of the 2019 novel humanpathogenic coronavirus isolated from a patient with atypical pneumonia after visiting Wuhan. Emerg Microbes Infec. 2020;9(1):221-36. DOI: 10.1080/22221751.2020.1719902.

Giovanetti M, Benedetti F, Campisi G, Ciccozzi A, Fabris S, Ceccarelli G, et al. Evolution patterns of SARS-CoV-2: Snapshot on its genome variants. Biochem Biophys Res Commun. 2021;538(10):88-91. DOI: 10.1016/j.bbrc.2020.10.102.

GeneTex. SARS-CoV-2 Omicron 变 体 的 突 变 位 点 [2021-11-29]. Available from: https://www.genetex.cn/MarketingMaterial/Index/newsletter_OmicronVariant.

Callaway E. Heavily mutated Omicron variant puts scientists on alert. Nature. 2021;600(7887):21. DOI:10.1038/d41586-021-03552-w.

Chen JH, Wang R, Gilby NB, Wei GW. Omicron (B.1.1.529): infectivity, vaccine breakthrough, and antibody resistance. ArXiv. 2021 Dec 1:arXiv:2112.01318v1.

Kupferschmidt K. Where did 'weird' Omicron come from? Science. 2021;374(6572):1179. DOI: 10.1126/science.acx9738.

Karim F, Moosa M, Gosnell B, Cele S, Giandhari J, Pillay S, et al. Persistent SARS-CoV-2 infection and intra-host evolution in association with advanced HIV infection. medRxiv. DOI: https://doi.org/10.1101/2021.06.03.21258228.

WHO South Africa HIV country profile 2021 [2021-12-01]. Available from: https://cfs.hivci.org/index.html.

Karim F, Gazy I, Cele S, Zungu Y, Krause R, Bernstein M, et al. HIV status alters disease severity and immune cell responses in Beta variant SARS-CoV-2 infection wave. Elife. 2021 Oct 5;10:e67397. DOI: 10.7554/eLife.67397.

Chandler JC, Bevins SN, Ellis JW, Linder TJ, Tell RM, Jenkins-Moore M, et al. SARS-CoV-2 exposure in wild whitetailed deer (Odocoileus virginianus). Proc Natl Acad Sci USA. 2021;118(47):e2114828118. DOI: 10.1073/pnas.2114828118.

Abbasi J. Omicron has reached the US - here's what infectious disease experts know about the variant. JAMA. 2021 Dec 28;326(24):2460-62. DOI: 10.1001/jama.2021.22619.

Callaway E, Ledford H. How bad is Omicron? What scientists know so far. Nature. 2021;600(7888):197-9. DOI: 10.1038/d41586-021-03614-z.

Chelsea News. The Omicron factor [2021-12-06]. Available from: http://www.chelseanewsny.com/news/theomicron-factor-EG1888116.

Metaculus. Estimated R0 of Omicron variant [2021-11-27]. Available from: https://www.metaculus.com/questions/8755/estimated-r0-of-omicron-variant/.

Our World in Data. Daily new confirmed COVID-19 cases [2021-12-09].

China Media Grand Mishmash. Omicron variant 37.5% more infectious than Delta [2021-11-30].

Republicworld. Omicron scare: Israeli health chiefs claim those vaccinated in last 6 months are protected [2021-12-01].

Pulliam JRC, van Schalkwyk C, Govender N, von Gottberg A, Cohen C, Groome MJ, et al. Increased risk of SARSCoV-2 reinfection associated with emergence of the Omicron variant in South Africa. medRxiv. DOI: 10.1126/science.abn4947.

Dyer O. Covid-19: South Africa's surge in cases deepens alarm over omicron variant. BMJ. 2021;375:n3013. DOI: https://doi.org/10.1136/bmj.n3013.

WHO Weekly epidemiological update on COVID-19 [2021-12-07]. Available from: https://www.who.int/publications/m/item/weekly-epidemiological-update-on-covid-19---7-december-2021.

CDC. Omicron variant: what you need to know [2021-12-09]. Available from: https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/variants/omicronvariant.html#:~:text=The%20Omicron%20variant%20spreads%20more,spread%20the%20virus%20to%20others.

Eminetra. WHO: most Omicron cases are "mild" or asymptomatic, and existing vaccines need to provide protection [2021-12-03].

SAMRS. Tshwane District Omicron variant patient profile: early features [2021-12-04].

Gao SJ, Guo H, Luo G. Omicron variant (B.1.1.529) of SARS-CoV-2, a global urgent public health alert! J Med Virol. 2022;94(4):1255-56. DOI: 10.1002/jmv.27491.

Cele S, Jackson L, Khan K, Khoury D, Moyo-Gwete T, Tegally H, et al. SARS-CoV-2 Omicron has extensive but incomplete escape of Pfizer BNT162b2 elicited neutralization and requires ACE2 for infection. medRxiv. DOI: 10.1038/s41586-021-04387-1.

CNBC Health & Science. Pfizer and BioNTech say booster dose provides high level of protection against omicron variant in initial lab study [2021-12-08].

Australian Government Department of Health. Additional border security measures to protect Australians from the new 'Omicron' COVID-19 variant [2021-11-27]. Available from: https://www.health.gov.au/news/additional-bordersecurity-measures-to-protect-australians-from-the-new-omicroncovid-19-variant.

Public Health Agency of Canada. Government of Canada introduces additional measures to address COVID-19 Omicron variant of concern [2021-11-30]. Available from: https://www.canada.ca/en/public-health/news/2021/11/government-of-canada-introduces-additional-measures-toaddress-covid-19-omicron-variant-of-concern.html.

##submission.downloads##

Опубліковано

2022-05-26

Номер

Розділ

ОРИГІНАЛЬНІ ДОСЛІДЖЕННЯ