Епідеміологічна характеристика SAR-CоV-2 Омікрон
DOI:
https://doi.org/10.24061/2413-0737.XXVI.2.102.2022.4Ключові слова:
COVID-19; SAR-CoV-2; ОмікронАнотація
Штам Омікрон вперше зареєстровано ВООЗ у Південній Африці 24 листопада 2021 р. Станом на початок 2022 р. випадки захворювання на Омікрон зареєстровано у понад 60 країнах та регіонах світу. Наразі Омікрон є домінуючим у світі штамом SAR-CoV-2 зі схильністю до швидкого розповсюдження. Хоча хвороба, викликана Омікроном, має переважно безсимптомний чи легкий перебіг, стрімке зростання показника захворюваності може викликати серйозне навантаження на глобальну систему охорони здоров’я. Окрім вищезазначеного, джерела мутацій, характер передачі збудника, його стійкість до вакцин є недостатньо вивченими, чим зумовлена перепона у боротьбі зі збудником у різних регіонах світу. У даній статті проаналізовано результати досліджень щодо характеристики збудника, його мінливості, особливостей передачі та можливих механізмів її реалізації, епідемічного статусу, можливостей профілактики та інших протиепідемічних заходів, з метою розробки заходів щодо боротьби з цим штамом SAR-CoV-2.
Посилання
WHO Coronavirus (COVID-19）Dashboard [2021-12-13]. Available from: https://covid19.who.int/.
WHO Tracking SARS-CoV-2 variants [2021-12-06]. Available from: https://www.who.int/en/activities/trackingSARS-CoV-2-variants/.
WHO Classification of Omicron (B.1.1.529：SARSCoV-2 variant of concern [2021-11-26]. Available from: https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-ofomicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern.
Munitsypal'na komisiia okhorony zdorov'ia Tian'tszinia [Municipal Commission for the Protection of Health of Tianjin].
(天津市卫生健康委员会) [2021-12-14] [Internet]. Available from: http://wsjk.tj.gov.cn/ZTZL1/ZTZL750/YQFKZL9424/FKDT12
/202112/t20211214_5749144.html. (in Ukrainian).
Departament okhorony zdorovia uriadu spetsialnoho administratyvnoho raionu Honkonhu [Department of Health of the Government of the Hong Kong Special Administrative Region] (香港特别行政区政府卫生署) [2021-11-25] [Internet]. Available from: https://sc.isd.gov.hk/TuniS/www.info.gov.hk/gia/general/202111/25/P2021112500378.htm. (in Ukrainian).
Gu H, Krishnan P, Ng DYM, Chang LDJ, Liu GYZ, Cheng SSM, et al. Probable transmission of SARS-CoV-2 Omicron variant in Quarantine Hotel, Hong Kong, China, November 2021. Emerg Infect Dis. 2022;28(2):460-62. DOI: 10.3201/eid2802.212422.
Holovne upravlinnia Natsional'noi komisii okhorony zdorov'ia, Upravlinnia derzhavnoho upravlinnia tradytsiinoi kytais'koi medytsyny. Diahnostyka ta plan likuvannia koronavirusnoi pnevmonii [Main Directorate of the National Health Commission, Department of Public Administration of Traditional Chinese Medicine. Diagnosis and treatment plan for coronavirus pneumonia] (国家卫生健康委员会办公厅，国家中医药管理局办公室 .新型冠状病毒肺炎诊疗方案) [2020-08-18] [Internet]. Available from: http://www.nhc.gov.cn/ yzygj/s7653p/202008/0a7bdf12bd4b46e5bd28ca7f9a7f5e5a.shtml. (in Ukrainian).
Chan JF, Kok KH, Zhu Z, Chu H, To KK, Yuan S, et al. Genomic characterization of the 2019 novel humanpathogenic coronavirus isolated from a patient with atypical pneumonia after visiting Wuhan. Emerg Microbes Infec. 2020;9(1):221-36. DOI: 10.1080/22221751.2020.1719902.
Giovanetti M, Benedetti F, Campisi G, Ciccozzi A, Fabris S, Ceccarelli G, et al. Evolution patterns of SARS-CoV-2: Snapshot on its genome variants. Biochem Biophys Res Commun. 2021;538(10):88-91. DOI: 10.1016/j.bbrc.2020.10.102.
GeneTex. SARS-CoV-2 Omicron 变 体 的 突 变 位 点 [2021-11-29]. Available from: https://www.genetex.cn/MarketingMaterial/Index/newsletter_OmicronVariant.
Callaway E. Heavily mutated Omicron variant puts scientists on alert. Nature. 2021;600(7887):21. DOI:10.1038/d41586-021-03552-w.
Chen JH, Wang R, Gilby NB, Wei GW. Omicron (B.1.1.529): infectivity, vaccine breakthrough, and antibody resistance. ArXiv. 2021 Dec 1:arXiv:2112.01318v1.
Kupferschmidt K. Where did 'weird' Omicron come from? Science. 2021;374(6572):1179. DOI: 10.1126/science.acx9738.
Karim F, Moosa M, Gosnell B, Cele S, Giandhari J, Pillay S, et al. Persistent SARS-CoV-2 infection and intra-host evolution in association with advanced HIV infection. medRxiv. DOI: https://doi.org/10.1101/2021.06.03.21258228.
WHO South Africa HIV country profile 2021 [2021-12-01]. Available from: https://cfs.hivci.org/index.html.
Karim F, Gazy I, Cele S, Zungu Y, Krause R, Bernstein M, et al. HIV status alters disease severity and immune cell responses in Beta variant SARS-CoV-2 infection wave. Elife. 2021 Oct 5;10:e67397. DOI: 10.7554/eLife.67397.
Chandler JC, Bevins SN, Ellis JW, Linder TJ, Tell RM, Jenkins-Moore M, et al. SARS-CoV-2 exposure in wild whitetailed deer (Odocoileus virginianus). Proc Natl Acad Sci USA. 2021;118(47):e2114828118. DOI: 10.1073/pnas.2114828118.
Abbasi J. Omicron has reached the US - here's what infectious disease experts know about the variant. JAMA. 2021 Dec 28;326(24):2460-62. DOI: 10.1001/jama.2021.22619.
Callaway E, Ledford H. How bad is Omicron? What scientists know so far. Nature. 2021;600(7888):197-9. DOI: 10.1038/d41586-021-03614-z.
Chelsea News. The Omicron factor [2021-12-06]. Available from: http://www.chelseanewsny.com/news/theomicron-factor-EG1888116.
Metaculus. Estimated R0 of Omicron variant [2021-11-27]. Available from: https://www.metaculus.com/questions/8755/estimated-r0-of-omicron-variant/.
Our World in Data. Daily new confirmed COVID-19 cases [2021-12-09].
China Media Grand Mishmash. Omicron variant 37.5% more infectious than Delta [2021-11-30].
Republicworld. Omicron scare: Israeli health chiefs claim those vaccinated in last 6 months are protected [2021-12-01].
Pulliam JRC, van Schalkwyk C, Govender N, von Gottberg A, Cohen C, Groome MJ, et al. Increased risk of SARSCoV-2 reinfection associated with emergence of the Omicron variant in South Africa. medRxiv. DOI: 10.1126/science.abn4947.
Dyer O. Covid-19: South Africa's surge in cases deepens alarm over omicron variant. BMJ. 2021;375:n3013. DOI: https://doi.org/10.1136/bmj.n3013.
WHO Weekly epidemiological update on COVID-19 [2021-12-07]. Available from: https://www.who.int/publications/m/item/weekly-epidemiological-update-on-covid-19---7-december-2021.
CDC. Omicron variant: what you need to know [2021-12-09]. Available from: https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/variants/omicronvariant.html#:~:text=The%20Omicron%20variant%20spreads%20more,spread%20the%20virus%20to%20others.
Eminetra. WHO: most Omicron cases are "mild" or asymptomatic, and existing vaccines need to provide protection [2021-12-03].
SAMRS. Tshwane District Omicron variant patient profile: early features [2021-12-04].
Gao SJ, Guo H, Luo G. Omicron variant (B.1.1.529) of SARS-CoV-2, a global urgent public health alert! J Med Virol. 2022;94(4):1255-56. DOI: 10.1002/jmv.27491.
Cele S, Jackson L, Khan K, Khoury D, Moyo-Gwete T, Tegally H, et al. SARS-CoV-2 Omicron has extensive but incomplete escape of Pfizer BNT162b2 elicited neutralization and requires ACE2 for infection. medRxiv. DOI: 10.1038/s41586-021-04387-1.
CNBC Health & Science. Pfizer and BioNTech say booster dose provides high level of protection against omicron variant in initial lab study [2021-12-08].
Australian Government Department of Health. Additional border security measures to protect Australians from the new 'Omicron' COVID-19 variant [2021-11-27]. Available from: https://www.health.gov.au/news/additional-bordersecurity-measures-to-protect-australians-from-the-new-omicroncovid-19-variant.
Public Health Agency of Canada. Government of Canada introduces additional measures to address COVID-19 Omicron variant of concern [2021-11-30]. Available from: https://www.canada.ca/en/public-health/news/2021/11/government-of-canada-introduces-additional-measures-toaddress-covid-19-omicron-variant-of-concern.html.
##submission.downloads##
Опубліковано
Номер
Розділ
Ліцензія
Авторське право (c) 2022 В.Д. Москалюк, Б.В. Сирота, І.В. Баланюк, Н.В. Чернецька, С.Р. Меленко, Т.Р. Колотило
Ця робота ліцензованаІз Зазначенням Авторства 3.0 Міжнародна.
Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див. The Effect of Open Access).
