Аналіз впливу поліморфних варіантів генів довгих некодуючих РНК (ANRIL, MALAT1, HOTAIR) на деякі клініко-патологічні показники у хворих на рак сечового міхура

Автор(и)

  • А. Волкогон канд. мед. наук, асистент кафедри хірургії та онкології Сумcького державного університету
  • В. Гарбузова д-р біол. наук, проф., завідувач наукової лабораторії молекулярно-генетичних досліджень Сумcького державного університету
  • І. Данілішин студент 2-го курсу Медичного інституту Сумcького державного університету
  • Д. Нечипоренко студент 2-го курсу Медичного інституту Сумcького державного університету
  • О. Атаман д-р мед. наук, проф. кафедри фізіології і патофізіології з курсом медичної біології Сумcького державного університету

DOI:

https://doi.org/10.24061/2413-0737.XXV.2.98.2021.3

Ключові слова:

поліморфізм генів; довга некодуюча РНК; ANRIL; MALAT1; HOTAIR; рак; сечовий міхур

Анотація

Мета роботи – аналіз можливої асоціації між поліморфними сайтами rs4977574 (ген ANRIL), rs3200401 (ген MALAT1), rs1899663 (ген HOTAIR) та розмірами пухлини і деякими даними клініко-лабораторних досліджень у хворих на перехідноклітинний рак сечового міхура (ПКРСМ).
Матеріал і методи. У дослідженні використано цільну венозну кров 141 пацієнта із ПКРСМ. Генотипування за поліморфними сайтами rs4977574 та rs3200401 виконували методом полімеразної ланцюгової реакції у режимі реального часу (Real-time PCR). Генотипування за локусом rs1899663 проводили методом полімеразної ланцюгової реакції із подальшим аналізом довжини рестрикційних фрагментів (PCR-RFLP). Математичний аналіз отриманих даних виконували за допомогою пакета програм SPSS (версія 17.0).
Результати. Установлено, що особи із ТТ-генотипом за rs3200401-поліморфізмом мають нижчий вміст гемоглобіну крові ((106,3 ± 23,9) г/л; Р = 0,014) та вищу концентрацію глюкози крові ((7,1 ± 2,3) ммоль/л; Р =
0,043) і креатиніну ((104,5 ± 33,8) мкмоль/л; Р = 0,022), ніж пацієнти із генотипом СС (відповідно: (131,1 ± 21,9) г/л); ((5,4 ± 1,5) ммоль/л); ((83,8 ± 18,5) мкмоль/л)). Також у ТТ-гомозигот показник ширини пухлини ((4,2 ± 1,7) см; Р = 0,027) достовірно вищий, ніж у гомозигот СС ((2,9 ± 1,1) см). Значущого зв’язку локусів rs4977574 та rs1899663 із досліджуваними показниками не виявлено.
Висновки. Поліморфізм rs3200401 гена MALAT1 асоційований із розміром пухлини та концентрацією гемоглобіну, глюкози та креатиніну у крові хворих на перехідноклітинний рак сечового міхура. Не виявлено зв’язку локусів rs1899663 та rs4977574 із клініко-патологічними характеристиками у хворих на перехідноклітинний рак сечового міхура.

Посилання

Humphrey PA, Moch H, Cubilla AL, Ulbright TM, Reuter VE. The 2016 WHO classification of tumours of the urinary system and male genital organs-part B: prostate and bladder tumours. Eur Urol. 2016;70(1):106-19. DOI: 10.1016/j.eururo.2016.02.028.

Bray F, Ferlay J, Soerjomataram I, Siegel RL, Torre LA, Jemal A. Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA Cancer J Clin. 2018;68(6):394-424. DOI: 10.3322/caac.21492.

DeGeorge KC, Holt HR, Hodges SC. Bladder Cancer: Diagnosis and Treatment. Am Fam Physician. 2017;96(8):507-14.

Motofei IG. Biology of Cancer; From Cellular Cancerogenesis to Supracellular Evolution of Malignant Phenotype. Cancer Invest. 2018;36(5):309-17. DOI: 10.1080/07357907.2018.1477955.

Nebbioso A, Tambaro FP, Dell'Aversana C, Altucci L. Cancer epigenetics: Moving forward. PLoS Genet. 2018;14(6):e1007362. DOI: 10.1371/journal.pgen.1007362.

Martens-Uzunova ES, Böttcher R, Croce CM, Jenster G, Visakorpi T, Calin GA. Long noncoding RNA in prostate, bladder, and kidney cancer. Eur Urol. 2014;65(6):1140-51. DOI: 10.1016/j.eururo.2013.12.003.

Wang L, Fu D, Qiu Y, Xing X, Xu F, Han C, et al. Genome-wide screening and identification of long noncoding RNAs and their interaction with protein coding RNAs in bladder urothelial cell carcinoma. Cancer Lett. 2014;349(1):77-86. DOI: 10.1016/j.canlet.2014.03.033.

Zhu H, Li X, Song Y, Zhang P, Xiao Y, Xing Y. Long non-coding RNA ANRIL is up-regulated in bladder cancer and regulates bladder cancer cell proliferation and apoptosis through the intrinsic pathway. Biochem Biophys Res Commun. 2015;467(2):223-28. DOI: 10.1016/j.bbrc.2015.10.002.

Martínez-Fernández M, Feber A, Dueñas M, Segovia C, Rubio C, Fernandez M, et al. Analysis of the Polycomb-related lncRNAs HOTAIR and ANRIL in bladder cancer. Clin Epigenetics. 2015;7:109. DOI: 10.1186/s13148-015-0141-x.

Sun X, Du P, Yuan W, Du Z, Yu M, Yu X, et al. Long non-coding RNA HOTAIR regulates cyclin J via inhibition of microRNA-205 expression in bladder cancer. Cell Death Dis. 2015;6(10):e1907. DOI: 10.1038/cddis.2015.269.

Li C, Cui Y, Liu LF, Ren WB, Li QQ, Zhou X, et al. High Expression of Long Noncoding RNA MALAT1 Indicates a Poor Prognosis and Promotes Clinical Progression and Metastasis in Bladder Cancer. Clin Genitourin Cancer. 2017;15(5):570-76. DOI: 10.1016/j.clgc.2017.05.001.

Zhan Y, Du L, Wang L, Jiang X, Zhang S, Li J, et al. Expression signatures of exosomal long non-coding RNAs in urine serve as novel non-invasive biomarkers for diagnosis and recurrence prediction of bladder cancer. Mol Cancer. 2018;17(1):142. DOI: 10.1186/s12943-018-0893-y.

Tung M, Wen Y, Wang S, Lin Y, Chow J, Yang S, et al. Impact of Long Non-Coding RNA HOTAIR Genetic Variants on the Susceptibility and Clinicopathologic Characteristics of Patients with Urothelial Cell Carcinoma. J Clin Med. 2019;8(3):E282.

Yang P, Hsieh M, Hung T, Wang S, Chen S, Lee M, et al. Effects of long noncoding RNA H19 polymorphisms on urothelial cell carcinoma development. Int J Environ Res Public Health. 2019;16(8):E1322.

Volkohon A, Chumachenko Ya, Roshchupkin A, Harbuzova V, Ataman O. Association between rs3200401 long non-coding RNA MALAT1 gene polymorphism and bladder cancer development. Bukovinian Medical Herald. 2019;23(3):23-7. DOI: 10.24061/2413-0737. XXIV.3.91.2019.57.

Volkohon A, Chumachenko Ya, Harbuzova V, Ataman O. Association analysis between rs1899663 HOTAIR gene polymorphism and bladder cancer development in Ukrainian population. Zaporozhye medical journal. 2019;21(6):751-58. DOI: 10.14739/2310-1210.2019.6.186498.

Volkohon A, Obukhova O, Harbuzova V, Ataman O. Analysis of association between long non-coding RNA ANRIL gene rs4977574 polymorphism and bladder cancer development. Fiziologichnyi Zhurnal. 2020;60(2-3):13-20.

Khorshidi HR, Taheri M, Noroozi R, Sarrafzadeh S, Sayad A, Ghafouri-Fard S. ANRIL genetic variants in Iranian breast cancer patients. Cell J. 2017;19(Suppl 1):72-8. DOI: 10.22074/cellj.2017.4496.

Taheri M, Pouresmaeili F, Omrani MD, Habibi M, Sarrafzadeh S, Noroozi R, et al. Association of ANRIL gene polymorphisms with prostate cancer and benign prostatic hyperplasia in an Iranian population. Biomark Med. 2017;11(5):413-22. DOI: 10.2217/bmm-2016-0378.

Hong JH, Jin EH, Chang IA, Kang H, Lee SI, Sung JK. Association of long noncoding RNA MALAT1 polymorphisms with gastric cancer risk in Korean individuals. Mol Genet Genomic Med. 2020;8(12):e1541. DOI: 10.1002/mgg3.1541.

Qu Y, Shao N, Yang W, Wang J, Cheng Y. Association of polymorphisms in MALAT1 with the risk of esophageal squamous cell carcinoma in a Chinese population. Onco Targets Ther. 2019;12:2495-2503. DOI: 10.2147/OTT.S191155.

Wang C, Li Y, Li YW, Zhang HB, Gong H, Yuan Y, et al. HOTAIR lncRNA SNPs rs920778 and rs1899663 are associated with smoking, male gender, and squamous cell carcinoma in a Chinese lung cancer population. Acta Pharmacol Sin. 2018;39(11):1797-1803. DOI: 10.1038/s41401-018-0083-x.

Yang X, He J, Chang Y, Luo A, Luo A, Zhang J, et al. HOTAIR gene polymorphisms contribute to increased neuroblastoma susceptibility in Chinese children. Cancer. 2018;124(12):2599-2606. DOI: 10.1002/cncr.31353.

Yuan LT, Chang JH, Lee HL, Yang YC, Su SC, Lin CL, et al. Genetic variants of lncRNA MALAT1 exert diverse impacts on the risk and clinicopathologic characteristics of patients with hepatocellular carcinoma. J Clin Med. 2019;8(9):1406. DOI: 10.3390/jcm8091406.

Li L, Sun R, Liang Y, Pan X, Li Z, Bai P, et al. Association between polymorphisms in long non-coding RNA PRNCR1 in 8q24 and risk of colorectal cancer. J Exp Clin Cancer Res. 2013;32(1):104. DOI: 10.1186/1756-9966-32-104.

Lin Y, Guo W, Li N, Fu F, Lin S, Wang C. Polymorphisms of long non-coding RNA HOTAIR with breast cancer susceptibility and clinical outcomes for a southeast Chinese Han population. Oncotarget. 2018;9(3):3677-89. DOI: 10.18632/oncotarget.23343.

Hassanzarei S, Hashemi M, Sattarifard H, Hashemi SM, Bahari G, Ghavami S. Genetic polymorphisms of HOTAIR gene are associated with the risk of breast cancer in a sample of southeast Iranian population. Tumour Biol. 2017;39(10):1010428317727539. DOI: 10.1177/1010428317727539.

Royds JA, Pilbrow AP, Ahn A, Morrin HR, Frampton C, Russell IA, et al. The rs11515 polymorphism is more frequent and associated with aggressive breast tumors with increased ANRIL and decreased p16 (INK4a) expression. Front Oncol. 2016;5:306. DOI: 10.3389/fonc.2015.00306.

##submission.downloads##

Опубліковано

2021-08-26

Номер

Розділ

ОРИГІНАЛЬНІ ДОСЛІДЖЕННЯ